Les principales entreprises thérapeutiques du microbiome façonnent l’avenir de la médecine de précision

Le microbiome devient de plus en plus la nouvelle frontière des sciences de la vie, les scientifiques étant à la recherche de découvertes potentielles. La thérapie du microbiome comprend des probiotiques, une greffe de microbiote fécal (FMT), des prébiotiques ou des microbes modifiés pour guérir des maladies telles que l'infection à C. difficile, les maladies inflammatoires de l'intestin et les troubles métaboliques. L’augmentation des initiatives de recherche et le nombre croissant d’infections intestinales ainsi que l’amélioration des capacités de séquençage du microbiome entraînent une croissance positive de l’industrie thérapeutique du microbiome. L’objectif principal des produits thérapeutiques du microbiome est de restaurer et de maintenir l’équilibre normal et le bon fonctionnement des organismes ou du microbiote intestinal. Les chercheurs, les investisseurs et les propriétaires d’entreprises observent de près le développement de thérapies liées au microbiome.

Alimenté par ces facteurs, Fortune Business Insights affirme que le marché desthérapies du microbiomea atteint 288,8 millions USD en 2025. Il devrait atteindre 4 023,1 millions USD en 2034, avec un TCAC de 34,90 % au cours de la période de prévision.

Fortune Business Insights révèle les 9 principales sociétés thérapeutiques du microbiome qui façonnent l'avenir des partenariats biotechnologiques

1. Seres Thérapeutique

Basée aux États-Unis, Seres Therapeutics est une société de biotechnologie au stade clinique, fabriquant de nouvelles thérapies composées de consortiums de bactéries vivantes sélectionnées. L'entreprise travaille également à traiter un large éventail de maladies en modulant la fonction du microbiome humain.

En mai 2021, Seres Therapeutics, Inc. a développé une nouvelle race de consortiums bactériens multifonctionnels capables d'entretenir une relation fonctionnelle avec les cellules et les tissus hôtes pour guérir diverses maladies. Le résultat du programme SER-109 a été le premier résultat clinique pivot positif obtenu à partir d’un candidat médicament ciblé sur le microbiome. Il a également reçu la désignation de médicament orphelin de la FDA. De plus, il a été désigné comme thérapie révolutionnaire et accepté par la FDA pour la demande de licence de produits biologiques pour le ser-109 en tant que thérapeutique expérimentale du microbiome pour traiter les c. infections difficiles (ICD).

2. Groupe thérapeutique Finch, Inc.

Finch Therapeutics Group, Inc. est une organisation thérapeutique du microbiome au stade clinique, spécialisée dans la production de médicaments biologiques administrés par voie orale. Son siège social est situé aux États-Unis. Le portefeuille de la société comprend une variété de stratégies de produits et de domaines thérapeutiques.

En janvier 2023, Finch Therapeutics s'est concentré sur la maximisation du potentiel de son portefeuille de propriété intellectuelle et d'autres sources disponibles. La société développe des produits précliniques sur le microbiome qui traiteront la colite ulcéreuse, la maladie de Crohn et les troubles du spectre autistique.

3. Ferrage

Basé en Suisse, Ferring est un groupe biopharmaceutique innovant et axé sur la recherche, spécialisé dans la santé reproductive, la santé maternelle, la gastro-entérologie et l'urologie. Créée en 1950, la mission de l'entreprise est d'aider chaque femme à concevoir des enfants et à maintenir une grossesse en bonne santé grâce à ses services de haute qualité.

En décembre 2023,Ferring Pharmaceuticals et PharmaBiome, société de microbiome basée à Zurich, ont annoncé une collaboration de recherche et développement pour faire progresser de nouvelles biothérapeutiques basées sur le microbiome dans le domaine de la gastro-entérologie. L'accord offrait à Ferring les droits exclusifs pour développer, fabriquer et commercialiser des produits thérapeutiques de nouvelle génération basés sur le microbiome dans le domaine de la gastro-entérologie.

4. MaaT Pharma

Basée en France, MaaT Pharma, une société de biotechnologie, qui développe des thérapies écosystémiques du microbiome visant à améliorer les résultats pour les patients atteints de cancer.

En juillet 2023, MaaT Pharma a rejoint le Microbiome Therapeutics Innovation Group (MTIG). Le MTIG est composé de plusieurs sociétés travaillant ensemble pour développer et rechercher des médicaments et produits candidats approuvés par la FDA à partir du microbiome.

5. Vedanta Biosciences, Inc.

Vedanta Biosciences, dont le siège social est aux États-Unis, est une société biopharmaceutique au stade clinique, parmi les 9 plus grandes sociétés thérapeutiques du microbiome, qui vise à développer une nouvelle catégorie de thérapies du microbiome oral basé sur consortiums bactériens définis. Contrairement aux greffes de microbiote fécal (FMT) traditionnelles qui dépendent des selles d’un donneur, les thérapies de Vedanta sont fabriquées à partir de banques de cellules bactériennes clonales pures. 

6. Nestlé Sciences de la Santé

Nestlé Health Science, dont le siège est en Suisse, est un leader mondial reconnu dans le domaine de la science nutritionnelle. La société propose également les dernières avancées en matière de nutrition grâce à sa vaste équipe de recherche et à son personnel de santé.

En juillet 2017, Nestlé Health Science, en collaboration avec Enterome, s'est associée pour former Microbiome Diagnostics Partners (MDP) afin de jouer un rôle de premier plan dans la création et la commercialisation de nouveaux diagnostics basés sur le microbiome. Cette coentreprise est une extension de la première contribution monétaire de Nestlé Health Science effectuée en avril 2016.

7. Evelo Biosciences

Evelo Biosciences, dont le siège est aux États-Unis, est une société de biotechnologie qui développe une plateforme pour les médicaments délivrés par voie orale. Les thérapies de la société sont efficaces, sûres et abordables pour les consommateurs du monde entier.

En avril 2016, Evelo Biosciences et l'Université de Chicago ont collaboré dans le cadre d'un accord de licence mondial exclusif pour développer et commercialiser une immunothérapie anticancéreuse basée sur le microbiome. La thérapie anticancéreuse, développée dans les laboratoires de Thomas Gajewski, professeur de médecine et de pathologie à UChicago, utilise des microbes intestinaux sélectionnés pour stimuler l’attaque du système immunitaire contre les cellules cancéreuses et améliorer l’efficacité des médicaments anticancéreux.

8. Entérome

Enterome, dont le siège est en France, est une société biopharmaceutique au stade clinique qui se concentre fortement sur la fabrication de médicaments immunomodulateurs pour le traitement du cancer.

En juin 2025, la biotechnologie française du microbiome Enterome a levé 19 millions de dollars en financement de série E pour faire progresser ses thérapies contre le cancer et les maladies inflammatoires de l'intestin vers des essais de phase I dans quelques semaines. Enterome développe des immunothérapies anticancéreuses basées sur des protéines produites par le microbiome intestinal humain, un ensemble de micro-organismes qui vivent dans nos intestins. Ces protéines sont appelées protéines « OncoMimic » qui imitent celles émises par cancer cellules qui peuvent inciter le système immunitaire à cibler des tumeurs spécifiques.

9. Synlogique

Synlogic, société biopharmaceutique au stade clinique située à Cambridge, aux États-Unis, se consacre au développement de médicaments biotiques synthétiques. Ils sont utilisés comme thérapies vivantes pour diverses maladies immunologiques et métaboliques en consommant ou en modifiant des substances pathogènes (métabolites) présentes dans le tractus gastro-intestinal (GI). Ils sont spécifiquement conçus pour ne pas être absorbés de manière systémique, de sorte qu’ils peuvent effectuer une guérison principalement en traitant uniquement le problème sous-jacent de l’intestin ; ainsi, les médicaments procurent des bienfaits curatifs locaux et aigus.

Les progrès de la médecine du microbiome seront-ils à l’origine de la prochaine avancée thérapeutique ?

L’avenir de la médecine du microbiome s’oriente vers des traitements intelligents adaptés au corps. La médecine du microbiome s’éloigne des traitements standards basés principalement sur l’ingestion de probiotiques pour se tourner vers des traitements médicaux « conçus » plus sophistiqués, adaptés spécifiquement à un individu. Lorsque les chercheurs utilisent l’intelligence artificielle, ils sont capables d’identifier et de cartographier les milliards d’organismes bactériens présents dans le tractus gastro-intestinal (tractus gastro-intestinal), permettant ainsi l’identification des médicaments spécifiques requis pour des maladies telles que le cancer, le diabète ou les maladies mentales. L’idée est d’aller au-delà de la seule utilisation des micro-organismes présents dans les excréments de donneurs humains en bonne santé. À cette fin, les neuf plus grandes sociétés de thérapie du microbiome développent une nouvelle forme de bactérie appelée « bactérie de conception » qui agira comme des mini-usines à l’intérieur du corps, libérant la quantité correcte de médicament uniquement lorsque cela est nécessaire. Même si ce domaine connaît actuellement une croissance rapide, l'objectif ultime au cours des dix prochaines années sera de garantir que ces « médicaments vivants » soient sûrs, cohérents et capables de survivre dans l'environnement interne unique d'une personne.